يختص بالآتي:

1.إصدار توصية لإستيراد أو تصدير الأدوية البشرية والبيطرية ومستحضرات التجميل والمستلزمات الطبية بعد مطابقتها للمواصفات المعتمدة.

2.إصدار شهادة تخليص للأدوية البشرية والبيطرية ومستحضرات التجميل والمستلزمات الطبية بعد مطابقتها للمواصفات المعتمدة.

3.إصدار توصية وشهادة تخليص لمدخلات الإنتاج للصناعة المحلية.

4.مراجعة و تحديث الإجراءات الخاصة بكل المعاملات التي ينظمها المجلس

5.مراجعة و تطوير قاعدة بيانات البرامج مما يسهل الإجراءات الخاصة بالتخليص الجمركى

6.إصدار عدم مطابقة وإعادة صادر للأصناف غير المطابقة.

7.تقديم الرأي الفني فيما يخص الإفراج أو حجز العينات والمنتجات الطبية مع الإجابة على إستفسارات ضباط الجمارك حولها.

8.مراقبة حركة تداول المواد المخدرة والمؤثرات العقلية والسلائف الكيميائية والأدوية المقيدة

9.متابعة الكشف على العينات والمنتجات الطبية بمخازن الجمارك.

10.  تعديل آمر السُّموم بإضافه المواد وتعديل الجداول .

11.  تنظيم عمل لجنة الأدوية المخدرة والمؤثرات العقلية.

12.  رفع تقارير الدورية الربع سنوية عن الإستهلاك ، الأدويه المخدرة والمؤثرات العقليه والسلائف الكيميائية.

13.  إعداد الإحصائيات السنوية الخاصة بالمواد المخدرة والمؤثرات العقلية والسلائف الكيميائية.

14.  التعاون مع الهيئات الدولية العاملة فى مجال المواد المخدرة والمؤثرات العقلية والسلائف الكيميائية والأدوية المُقيدة.

15.  التعاون مع شرطة مكافحة المخدرات فى إطار منع تداول الأدوية المخدرة والمؤثرات العقليه والسلائف الكيميائية خارج القنوات الرسمية.